超凈工作臺的潔凈環境是在特定的空間內，潔凈空氣(進濾空氣)按設定的方向流動而形成的。以氣流方向來分，現有的超凈工作臺可分為垂直式，由內向外式以及側向式。從操作質量和對環境的影響來考慮，以垂直式較*。由供氣濾板提供的潔凈空氣以一個特定的速度下降通過操作區，在大約操作區的中間分開，由前端空氣吸入孔和后吸氣窗吸走，在操作區下部前后部吸入的空氣混合在一起，并由鼓風機泵入后正壓區，在機器的上部，30%的氣體通過排氣濾板從頂部排出，大約70%的氣體通過供氧濾板重新進入操作區。為補充排氣口排出的空氣，同體積的空氣通過操作口從房間空氣中得到補充。這些空氣不會進入操作區，只是形成一個空氣屏障。
超凈工作臺使用前應用紫外燈照射30-40分鐘，并檢查操作區周圍各種可開啟的門窗處于工作時位置。操作在操作區的中心位置進行，在設計上，這是一個較安全的區域。在進行操作前應對實驗材料有一個初步的認識，同時了解自已所使用的設備的性能及安全。嚴格執行實驗室安全規程。特定病原在任何超凈工作臺中的使用必須進行安全性評估。如果實驗材料會對周圍環境造成環境污染，就應避免在無排氣濾板的型號內使用，因為在流動空氣中操作與散du無異。任何先進的設備并不能保證實驗的成功，動物檢疫實驗室超凈工作臺的使用是以無菌和避免交叉污染為目的，因此熟練的操作和明確的無菌要領是不可少的。
超凈工作臺的優點是操作方便自如，比較舒適，工作效率高，預備時間短，開機30分鐘以上即可操作，基本上可隨時使用。在工廠化生產中，接種工作量很大，需要經常長久地工作時，超凈臺是很理想的設備。
超凈工作臺由三相電機作鼓風動力，功率145～260W左右，將空氣通過由特制的微孔泡沫塑料片層疊合組成的“濾清器"后吹送出來，形成連續不斷的無塵無菌的超凈空氣層流，即所謂“高效的特殊空氣"，它除去了大于0.3μm的塵埃、真菌和細菌孢子等等。超凈空氣的流速為24~30m/min，這已足夠防止附近空氣可能襲擾而引起的污染，這樣的流速也不會妨礙采用酒精燈或本生燈對器械等的灼燒消毒。工作人員就在這樣的無菌條件下操作，保持無菌材料在轉移接種過程中不受污染。但是萬一操作中途遇到停電，暴露在未過濾空氣中的材料便難以幸免污染。這時應迅速結束工作，并在瓶上作出記號，內中的材料如處于增殖階段，則以后不再用作增殖而轉入生根培養。如為一般性生產材料，因極其豐富也可棄去。如處于生根過程，則可留待以后種植用。
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